Лаборатория молекулярной генетики

Заведующий лабораторией

Вербенко Валерий Николаевич, доктор биологических наук
Verbenko_VN@pnpi.nrcki.ru

Основные направления деятельности

  • Молекулярно-генетические механизмы гиперрекомбинации и гиперрадиоустойчивости у про- и эукариот;
  • молекулярно-генетические механизмы развития злокачественных новообразований;
  • биоремедиация и нетермическая стерилизация.

Основные задачи

В рамках фундаментальных исследований:
  • исследование роли белков-регуляторов ДНК-трансфераз и репаративных ДНК-геликаз у бактерий;
  • сайт-направленный мутагенез хламидомонады;
  • исследование генетического профиля злокачественных новообразований, включая множественные, при колоректальном раке;
  • исследование взаимодействия цитомегаловируса с транскрипционными факторами клетки.
В рамках прикладных исследований:
  • разработка методов ранней диагностики колоректального рака;
  • исследование роли цитомегаловирусной инфекции в злокачественной трансформации и устойчивости к терапии;
  • поиск микроорганизмов, селективно накапливающих тяжелые металлы и радионуклиды.

Основные результаты

  • на основе анализа комплекса RecX с пресинаптическим филаментом RecA был сконструирован пептид с альфа спиральной структурой, который ингибирует RecA как в реакциях in vitro, так и в реакции SOS-ответа бактерий, что открывает возможности для подавления развития антибиотикоустойчивости в ходе лечения;
  • оптимизированы протоколы редактирования генов нескольких штаммов, используя цинк-пальцевые нуклеазы (ZNFs) и систему CRISPR/Cas9 и разрушены гены фоторецепции COP1/COP2, COP3 (кодирующие субъединицы белка канала родопсина 1 ChR1), COP4, COP5, PHOT, UVR8, VGCC, MAT3 и aCRY , а также созданы двойные мутанты;
  • установлено, что репаративная геликаза UvrD D. radiodurans по сравнению с гомологом из E. coli обладает широкой субстратной специфичностью;
  • разработана ПЦР-диагностики колоректального рака на основе целостности ДНК, выделенной из фекалий пациента;
  • установлено, что ингибитор полиаминового катаболизма восстанавливает чувствительность клеток THP-1, инфицированных ЦМВ, к доксорубицину;
  • выделены микроорганизмы, накапливающие никель – наиболее распространенный индустриальный поллютант.

Публикации