Лаборатория молекулярной генетики
Заведующий лабораторией
Вербенко Валерий Николаевич, доктор биологических наук
Verbenko_VN@pnpi.nrcki.ru
Основные направления деятельности
- Молекулярно-генетические механизмы гиперрекомбинации и гиперрадиоустойчивости у про- и эукариот;
- молекулярно-генетические механизмы развития злокачественных новообразований;
- биоремедиация и нетермическая стерилизация.
Основные задачи
В рамках фундаментальных исследований:
- исследование роли белков-регуляторов ДНК-трансфераз и репаративных ДНК-геликаз у бактерий;
- сайт-направленный мутагенез хламидомонады;
- исследование генетического профиля злокачественных новообразований, включая множественные, при колоректальном раке;
- исследование взаимодействия цитомегаловируса с транскрипционными факторами клетки.
В рамках прикладных исследований:
- разработка методов ранней диагностики колоректального рака;
- исследование роли цитомегаловирусной инфекции в злокачественной трансформации и устойчивости к терапии;
- поиск микроорганизмов, селективно накапливающих тяжелые металлы и радионуклиды.
Основные результаты
- на основе анализа комплекса RecX с пресинаптическим филаментом RecA был сконструирован пептид с альфа спиральной структурой, который ингибирует RecA как в реакциях in vitro, так и в реакции SOS-ответа бактерий, что открывает возможности для подавления развития антибиотикоустойчивости в ходе лечения;
- оптимизированы протоколы редактирования генов нескольких штаммов, используя цинк-пальцевые нуклеазы (ZNFs) и систему CRISPR/Cas9 и разрушены гены фоторецепции COP1/COP2, COP3 (кодирующие субъединицы белка канала родопсина 1 ChR1), COP4, COP5, PHOT, UVR8, VGCC, MAT3 и aCRY , а также созданы двойные мутанты;
- установлено, что репаративная геликаза UvrD D. radiodurans по сравнению с гомологом из E. coli обладает широкой субстратной специфичностью;
- разработана ПЦР-диагностики колоректального рака на основе целостности ДНК, выделенной из фекалий пациента;
- установлено, что ингибитор полиаминового катаболизма восстанавливает чувствительность клеток THP-1, инфицированных ЦМВ, к доксорубицину;
- выделены микроорганизмы, накапливающие никель – наиболее распространенный индустриальный поллютант.
Публикации